消毒灭菌是预防疾病传播和保障公共卫生安全的重要措施。其基本原则主要包括以下几点：

首先，针对性原则。不同病原体对消毒剂的敏感性不同，因此需根据具体情况选择合适的消毒方法和消毒剂。例如，细菌芽孢对一般消毒剂有较强抵抗力，需选用高效消毒剂。

其次，全面性原则。消毒时应确保所有可能被污染的物体表面和空气都得到处理，不留死角。特别是在医疗机构和食品加工场所，更需严格执行。

第三，适时性原则。消毒应在最有效的时间段内进行，如疫情爆发初期或污染事件发生后立即进行，以阻断病原体的传播途径。

第四，安全性原则。选择消毒剂时需考虑其对人和环境的危害性，确保在有效消毒的同时，不对人体健康和生态环境造成负面影响。

最后，标准化操作原则。消毒灭菌应严格按照相关标准和操作规程进行，确保消毒效果。包括消毒剂的浓度配比、作用时间、使用方法等均需规范操作。

总之，科学、规范的消毒灭菌是保障公共卫生安全的关键，遵循上述基本原则，方能有效切断病原体的传播途径，保护人民群众的健康。